英偉達公司宣布,全球最大的基因組研究所華大基因正在推出一項服務(wù),該服務(wù)讓世界各地的研究人員能夠以較低的價格在云端執(zhí)行下一代定序(NGS)生物信息學分析。
全新的“EasyGenomics ” 服務(wù)由位于中國深圳的華大基因提供,該項服務(wù)將直觀的用戶界面與華大基因自動化的流水線分析、軟件以及工具相結(jié)合。它們與業(yè)內(nèi)最大的定序平臺集成在一起,為生物學家、生物信息學家以及最終為內(nèi)科醫(yī)生提供所需的全部內(nèi)容,使其能夠提交和收到DNA定序數(shù)據(jù)的自動化分析。
英偉達GPU可加速處理大型DNA數(shù)據(jù)分析,與使用基于CPU的系統(tǒng)相比,能夠令處理時間從數(shù)日縮短至區(qū)區(qū)數(shù)小時。EasyGenomics由英偉達GPU加速,因而為全球研究人員大大擴展了高級基因組研究功能的可用性,讓科學離低價可行的個性化藥品時代更近一步。
針對2012年Bio-IT World展會上符合資格要求的生物學家和生物信息學家,華大基因現(xiàn)在正在推出這項全新服務(wù)的有限免費試用。如需了解更多信息或如需申請免費試用,敬請訪問EasyGenomics網(wǎng)站。
華大基因副總裁方林(音譯)博士表示:“通過讓更多研究人員以更低的價格更輕松地加速DNA定序數(shù)據(jù),我們希望能夠便于醫(yī)生在臨床診斷以及復(fù)雜的疾病研究中把運用基因組作為醫(yī)療工作的一個可行的組成部分。GPU加速讓科學家能夠比以往更快地分析DNA定序數(shù)據(jù),將所用的時間從五天縮短至短短五個小時。 在云端充分完成部署之后,我們預(yù)計EasyGenomics將在基因組研究領(lǐng)域中掀起革命。”
EasyGenomics云服務(wù)采用基于英偉達(NVIDIA) Tesla M2070和M2075 GPU的混合型計算系統(tǒng),這些 GPU連同系統(tǒng)CPU一起為DNA定序數(shù)據(jù)分析加速。當EasyGenomics服務(wù)充分完成部署時,華大基因計劃新增數(shù)以百計的英偉達Tesla GPU來對其進行升級,屆時預(yù)計該服務(wù)將支持數(shù)以千計的用戶。
英偉達公司Tesla事業(yè)部高級總監(jiān)Sumit Gupta表示:“由于定序成本的下降,今年或?qū)⒊蔀?,000美元基因組之年。我們很快將淹沒在基因組定序的海量數(shù)據(jù)當中。華大基因的EasyGenomics服務(wù)利用GPU計算的處理能力來為科學家提供一條低價且簡單易用的途徑,使其能夠輕松解決這種全新的大型基因數(shù)據(jù)問題,讓我們能夠離有效而低價的個性化醫(yī)療更近一步。”
從植物與大腸桿菌到大熊貓,在對各種生命形式進行基因組定序這方面,華大基因從事著開創(chuàng)性的工作,目的是開發(fā)出更好的藥物、改善醫(yī)療以及開發(fā)出基因更優(yōu)秀的食物。 華大基因總部位于中國深圳,在美國馬薩諸塞州坎布里奇和丹麥哥本哈根設(shè)有分支機構(gòu),其目標是讓最前沿的基因組科學得到普及。
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